南京博物院之前身是1933年由我国近代民主革命家、教育家蔡元培先生倡议创建的国立中央博物院筹备处，集全国第一流珍品约二、三十万件，其中包括绘画中的《历代帝后像》、《唐明皇幸蜀图》、铜器中的《毛公鼎》、《司母戊鼎》等稀世国宝；一批著名专家云集于此，如李济、吴金鼎、夏鼐、曾昭燏、王天木等，为全国第一座仿照欧美博物馆建馆的现代综合性大型博物馆。 目前有各类藏品42万件，国宝级文物和国家一级文物有二千件以上。全院有各类专业人员170余人，其中具有中高级职称的占50%以上。设有考古研究所、民族民俗研究所、古代艺术研究所、文物保护技术研究所、古建筑研究所、陈列艺术研究所等六个研究所，文化交流中心、信息中心、《东南文化》杂志社，以及保管部、文物征集部、图书馆、办公室、保卫部、服务部等职能部门。 考古发掘乃南京博物院的优良传统。在华东地区产生较大影响的大型考古发掘，都有南京博物院立下的汗马功劳。值得一提的是自1990年开始评选中国十大考古新发现以来，南京博物院主持发掘的考古项目先后有昆山赵陵山（1992年）、高邮龙虬庄（1993年）、唐代扬州城（1993年）、徐州狮子山（1995年）、金坛三星村（1998年）、江阴高城墩（1999年）、连云港藤花落（2000年）、江苏无锡鸿山越国贵族墓（2004年）、江苏句容、金坛周代土墩墓群（2005年）等被评为中国十大考古新发现；金坛三星村遗址、连云港藤花落遗址的考古发掘还分获国家田野考古三等奖和二等奖。 陈列展览亦南京博物院的工作强项。从建院至今，所举办的大型展览和各种专题展览数以千计。其中最具影响的是“江苏历史陈列”、“长江下游五千年文明展”和“江苏考古陈列”等。而1999年开放落成的南京博物院艺术陈列馆，获国家文物局颁发的“2000年度十大陈列精品奖”，在国内外引起极大的影响。 南京博物院文物保护技术研究起步于70年代中、后期，自1983年“旧纸张保护技术”科研成果获文化部科技成果一等奖以来，先后有“纸张脱酸”（1985年）、“复方中草药杀虫剂”（1989年）、“纸张气相脱酸”（1990年）、“脱胶剂的研制”（1990年）、“图书整本加固技术”（1993年）、“青铜文物保护新技术的研究”（1996年）、“新型古建筑白蚁防治剂”（1999年）等获国家、文化部、科技部、国家文物局的科技进步奖。2003年，南京博物院承担了“十五”国家科技攻关项目《文物保护技术和中华文明探源》之“古代丝织品的病害及其预防”项目，经过三年的努力项目已经完成并顺利通过国家文物局组织的专家验收。 南京博物院的发展凝聚了几代南博人的心血和期盼，目前正以前所未有的现代化、科学化、专业化管理与世界博物馆接轨，走在二十一世纪大道上。